Собрание научной библиотеки музея-заповедника «Ростовский кремль» многочисленно и разнообразно. 
Уже среди первых экспонатов Музея церковных древностей (1883) экспонировались старопечатные книги, документы с автографами царственных особ и государственных деятелей, рукописные синодики, грамоты царя Алексея Михайловича, келейный летописец святителя Димитрия и многое другое.
С момента основания музея начинается и комплектование библиотечного фонда. Первые поступления были из личных собраний - Д. Булатова, Н. Селифонтова, К. Подгорского, А. Титова, а также от Академии наук, Московского главного архива, Министерства иностранных дел.
Сотрудники музея изучают книжный фонд, составляют каталоги. А.А. Титов, один из организаторов музея, составил «Описание рукописей Ростовского музея церковных древностей» и «Охранный каталог рукописей». М.А. Липинский выполнил «Описание собрания документов, принадлежащих музею».
После революции библиотека музея значительно пополняется. Рукописный фонд возрастает от 477 до 3442 единиц. 
Большое число книг и документов поступает из бывших усадеб местных дворян - Леонтьевых, Бутурлиных, Мордвиновых, местных церквей и монастырей - делопроизводственные документы, церковная литература.
Научная библиотека музея имеет большое научное, историческое и художественное значение. Это уникальное собрание рукописных книг и документов раннего периода с XVIII в., коллекция столбцов XVII-XVIII вв., подлинные царские грамоты XVI-XVIII вв., книги кириллической и гражданской печати с 1662 г., книги на иностранных языках -- немецком, английском, французском, латыни, греческом и др.
Богат книжный фонд библиотеки периода XIX в. по наши дни, он насчитывает более 31 тысячи единиц. Среди них много ценных и редких книг. Насчитывается более 1000 книг с автографами известных деятелей XIX-XX вв. Е.В. Барсова, А.Ф. Бычкова, В.В. Верещагина, Н.К. Рериха, А.С. Уварова и многих других из тех интеллектуалов прошлого, кто был неравнодушен к судьбе ростовских памятников и сыграл особую роль в их возрождении.
Собрание музейной библиотеки постоянно изучается: в 1958 г. В.В. Лукьянов составил «Краткое описание рукописей Ростовского музея». Над научным описанием рукописей работала археографическая экспедиция Ярославского университета под руководством А.А. Севастьяновой. В двух сборниках музея ("Труды Ростовского музея" (1991) и "Сообщения Ростовского музея", Вып. 2 (1991)) опубликован "Каталог памятников письменности Ярославской области".
Сотрудники библиотеки музея постоянно работают над составлением каталогов, выявляют редкие книги, книги с автографами. Вся эта работа дает возможность пользователям библиотеки знакомиться с составом коллекций, заказать книгу, статью, документ для ознакомления и изучения.
Все это делает научную библиотеку музея местом работы для российских и зарубежных специалистов, студентов вузов, старших школьников.
КАК ДОБРАТЬСЯ